Bên cạnh những phân đoạn ngọt ngào ở đầu tập 39 của cả 2 cặp đôi thì sang đến tập 40, Hậu duệ mặt trời bản Việt lại khiến khán giả thót tim khi theo dõi quá trình bác sĩ Hoài Phương (Khả Ngân) chật vật đưa đại úy Duy Kiên (Song Luân) quay trở về từ Quỷ môn quan.
Cụ thể, trong lúc thực hiện nhiệm vụ đặc biệt, Duy Kiên được đưa vào bệnh viện trong tình trạng nguy kịch. Người lạ mặt xuất hiện khi Bảo Huy (Hữu Vi) và Minh Ngọc (Cao Thái Hà) nói chuyện ở tập 39 chính là người lính đến từ Đi-men tên Mark. Anh ta từng đối đầu với họ ngay ở tập đầu tiên khi đội NH1 tham gia nhiệm vụ giải cứu một chiếc tàu bị cướp biển chiếm.
Tuy nhiên, Mark không phải là người khiến Duy Kiên bị thương mà lại là một nhóm người mặc áo đen bịt mặt đến từ Đi-men muốn tiêu diệt anh ta. Chưa kịp nói với Duy Kiên một lời nào, Mark đã bị bắn hạ với nhiều phát đạn và bị đưa lên xe ô tô.
Vì đuổi theo mà Duy Kiên bị chúng bắn dẫn đến bị thương nặng. Bộ dạng máu me của chàng đại úy đã khiến Hoài Phương vô cùng hoảng loạn. Ngay khi vừa trông thấy tình trạng nguy kịch của người yêu, Hoài Phương không kìm được cảm xúc mà bàng hoàng tựa vào người bác sĩ Quang vì không còn đứng vững nổi nữa.
Dù vậy, cô vẫn cố gắng hết sức để cứu chữa cho anh. Trong quá trình cấp cứu, đã có lúc tim của Duy Kiên bất ngờ ngừng đập. Những tưởng anh chàng sẽ khó qua khỏi nhưng may mắn là sau đó Hoài Phương đã thành công giúp anh quay trở về từ “cõi âm”.
Ngoài ra khán giả còn thót tim bởi những cảnh hành động gay cấn khi Mark xuất hiện và màn đấu súng giữa Duy Kiên, Bảo Huy với những kẻ lạ mặt. Ngoài Duy Kiên, Mark cũng được đưa vào bệnh viện trong tình trạng thương tích đầy mình. Do không muốn bất cứ ai tiếp cận, anh ta đã uy hiếp y tá Mai.
Trong khi tất cả bác sĩ và y tá đều hốt hoảng, Duy Kiên đã xuất hiện kịp thời để tìm cách giải quyết. Ngay lúc đôi bên đang đàm phán, người lính tên Mark bất ngờ ngất xỉu. Duy Kiên đã nhanh chóng yêu cầu Hoài Phương giúp đỡ anh ta. Sang tập này, khán giả mới hiểu được anh lính Đi-men mà Duy Kiên chạm mặt ngay ở tập đầu hiện đang bị truy đuổi vì bị hiểu nhầm là kẻ phản bội.
Sau khi được chữa trị, từ người lính nay lại trở thành bệnh nhân, Duy Kiên buộc phải nghe theo lời của nữ bác sĩ kiêm bạn gái xinh đẹp Hoài Phương. Tuy lúc nào cũng tỏ ra cau có, song thực tế Hoài Phương lại hết sức lo lắng cho tình hình của người yêu.
Tập 40 khép lại với việc Duy Kiên và Bảo Huy cùng NH1 nỗ lực để tìm ra được chân tướng của sự việc. Không sợ quân địch, không sợ cái chết nhưng đại úy Duy Kiên lại sợ bạn gái nhất. Mặc dù tung hoành ngang dọc nhưng anh lại tỏ vẻ ngoan ngoãn trước mặt người đẹp. Tập 41, 42 của Hậu duệ mặt trời bản Việt sẽ được phát sóng vào lúc 19g00 ngày 12/11/2018.